Entropie d’échantillon

Autres noms : SampEn, SampEn(m, r)

Degré d’imprévisibilité de la série de battements : l’opposé du logarithme de la probabilité que des séquences de battements semblables le restent une fois allongées d’un battement. Près de 0, la série se répète ; à 2 ou plus, elle est proche du hasard.

Unité : nats

SampEn(m,r)=−ln⁡AB\mathrm{SampEn}(m, r) = -\ln\frac{A}{B}

L’entropie d’échantillon est un nombre qui indique à quel point le prochain battement est imprévisible au vu des précédents : c’est l’opposé du logarithme népérien de la probabilité que deux séquences de mm battements qui concordent à une tolérance rr près concordent encore quand toutes deux sont allongées d’un battement. Elle n’a pas d’unité.

Pourquoi cette mesure existe

Richman et Moorman l’ont introduite en 2000 pour corriger deux défauts de l’ancienne entropie approximative Entropie approximative Mesure plus ancienne que l’entropie d’échantillon, sans unité : indicateur de régularité qui compte chaque séquence de battements comme concordant avec elle-même, d’où un biais vers les valeurs basses sur les enregistrements courts. En savoir plus sur Entropie approximative  : celle-ci comptait chaque séquence comme concordant avec elle-même, ce qui la faussait dans le sens de la régularité, et sa valeur variait avec la longueur de l’enregistrement. L’entropie d’échantillon supprime ces autoconcordances et compte les deux ensembles de concordances sur les mêmes séquences : elle suit donc de plus près les valeurs théoriques sur des données aléatoires et peut se calculer sur des enregistrements courts, de moins de 200 battements. L’idée est la même pour les deux. Une série qui se répète est prévisible : presque toutes les concordances sur mm battements survivent à un battement de plus et l’entropie est proche de 0 ; une série aléatoire est imprévisible, peu de concordances survivent et l’entropie est élevée. La prise de position de 2015 de Sassi et ses collègues la range parmi les mesures d’entropie et de régularité qui ont approfondi la compréhension du signal sans encore beaucoup apporter en clinique.

La formule

SampEn(m,r)=−ln⁡AB\mathrm{SampEn}(m, r) = -\ln\frac{A}{B}

Choisissez une longueur de séquence mm (en général 2 battements) et une tolérance rr (en général 0,2 fois l’écart type des intervalles). BB est le nombre de paires de séquences différentes de mm battements dont chaque battement se trouve à moins de rr de celui de l’autre séquence ; AA est le nombre de ces paires qui concordent encore quand les deux séquences sont étendues à m+1m+1 battements. Prenez le logarithme népérien de A/BA/B et changez-en le signe. Les valeurs sont en nats, l’unité d’un logarithme népérien, même si Indice de stress de Baevsky Un nombre sans unité tiré de l’histogramme des intervalles entre battements. Il monte quand le rythme devient plus stable et moins variable, ce que Baevsky interprétait comme une régulation de l’organisme sous tension. En savoir plus sur Indice de stress de Baevsky la plupart des logiciels les affichent sans unité.

Exemple détaillé

Le prochain battement est-il prévisible ?

Cinq minutes de l’enregistrement d’exemple

SampEn
1,67
ApEn
1,02
Tolérance r
5,7 ms
Concordances sur m
13
Concordances sur m+1
1

Au repos, m = 2, r = 0,20 × écart type = 5,7 ms. La séquence de 2 battements en surbrillance concorde avec 13 autres séquences à 5,7 ms près ; 1 d’entre elles concorde encore lorsque les deux séquences comptent un battement de plus. Comptée sur toutes les séquences de l’enregistrement, l’entropie d’échantillon est de 1,67 : le rythme respiratoire rend le battement suivant en partie prévisible.

Les commandes fonctionnent lorsque JavaScript est activé.

Les 64 premiers battements de l’enregistrement d’exemple. Une séquence de m battements est mise en évidence, avec une bande de ±r autour de chaque battement ; toute autre séquence qui reste dans la bande est une concordance, et les cases plus foncées sont les concordances qui tiennent encore avec un battement de plus. L’entropie d’échantillon (SampEn) est l’opposé du logarithme de la proportion de concordances qui subsistent, comptée sur tout l’enregistrement ; l’entropie approximative (ApEn) en est la cousine plus ancienne. Changez m et r, ou passez à une série périodique ou aléatoire.

Un graphique en courbe de 64 intervalles cardiaques dans l’ordre. Une case en surbrillance marque une séquence modèle de m battements, avec une bande de tolérance de plus ou moins r millisecondes autour de chacun ; des cases plus claires marquent les autres séquences de m battements qui concordent avec le modèle dans la bande, et des cases plus foncées celles qui concordent encore lorsque les deux séquences comptent un battement de plus. Des indicateurs donnent l’entropie d’échantillon, l’entropie approximative, la tolérance en millisecondes et les deux nombres de concordances, suivis d’une phrase qui les explique. Deux curseurs règlent m (1 à 4 battements) et r (0,1 à 0,6 fois l’écart type) ; trois boutons choisissent une série périodique, l’enregistrement au repos ou des battements aléatoires.

Cinq minutes de l’enregistrement d’exemple donnent une entropie d’échantillon de 1,67 avec m=2m = 2 et rr = 5,7 ms. La séquence de deux battements mise en évidence concorde avec 13 autres séquences, dont 1 concordent encore avec un battement de plus. Une série parfaitement périodique donne 0,01 ; des battements aléatoires de même dispersion donnent 2,35. Élargissez rr et presque tout concorde : le nombre baisse, quelle que soit la série.

Ce qui la fait varier

La respiration : un rythme respiratoire régulier rend les battements en partie prévisibles et la fait baisser ; une respiration irrégulière la fait monter. Les battements ectopiques Battement ectopique Battement qui naît hors du stimulateur naturel du cœur et arrive en général trop tôt. Ces battements sont courants, mais ils faussent la VFC s’ils ne sont pas retirés ou corrigés. En savoir plus sur Battement ectopique et le bruit la font monter. Le choix de mm et de rr la fait beaucoup varier, c’est pourquoi Kubios retient par défaut m=2m = 2 et r=0.2×SDNNr = 0.2 \times \mathrm{SDNN}. Sassi et ses collègues rapportent que les mesures d’entropie diminuent avec l’âge et pendant un test d’inclinaison, et Shaffer et Ginsberg la relient à la régularité et à la complexité.

Quand elle induit en erreur

Quand deux logiciels utilisent des mm, des rr ou des longueurs différents, les valeurs ne sont pas comparables. Dans les séries très régulières (respiration à rythme imposé), elle est proche de 0 par construction, et quand aucune séquence ne concorde sur m+1m+1 battements, elle n’est pas définie, ce qu’un logiciel peut afficher comme un très grand nombre. Elle exige aussi une série propre, car les artefacts Artefact Erreur dans un enregistrement des battements, comme un battement manqué, en trop ou mal daté, souvent due à un mouvement ou à un mauvais contact du capteur. Les artefacts peuvent fortement fausser les valeurs de VFC. En savoir plus sur Artefact ajoutent une irrégularité qui ressemble à de la complexité.

Où vous la verrez

Kubios HRV affiche la SampEn (avec l’ApEn, le DFA DFA α1 L'exposant d'échelle à court terme de l'analyse des fluctuations redressées. Près de 1, les battements ont une mémoire à toutes les échelles ; près de 0,5, ils se comportent comme du bruit. L'α2 est la même pente sur des durées plus longues. En savoir plus sur DFA α1 , la dimension de corrélation, les mesures de récurrence et l’entropie multi-échelle) parmi ses mesures non linéaires. Des articles de recherche l’utilisent, par exemple sur le vieillissement et chez les nouveau-nés, où elle a permis de prédire un sepsis chez des bébés nés prématurément ; les montres et les bagues connectées ne l’affichent pas. La page Mesures non linéaires de VFC : en ai-je besoin ? examine si tout cela compte pour quelqu’un qui porte une montre ou une bague connectée.

Sources

  1. Physiological time-series analysis using approximate entropy and sample entropy American Journal of Physiology: Heart and Circulatory Physiology, 2000
  2. Advances in heart rate variability signal analysis: joint position statement by the e-Cardiology ESC Working Group and the European Heart Rhythm Association co-endorsed by the Asia Pacific Heart Rhythm Society Europace, 2015
  3. An overview of heart rate variability metrics and norms Frontiers in Public Health, 2017
  4. HRV analysis methods Kubios

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