Приближённая энтропия

Другие названия: ApEn, ApEn(m, r)

Предшественница выборочной энтропии, без единицы измерения: показатель регулярности, который засчитывает каждому отрезку совпадение с самим собой и поэтому на коротких записях занижен.

Единица измерения: нат

ApEn(m,r)=Φm(r)−Φm+1(r)\mathrm{ApEn}(m, r) = \Phi^{m}(r) - \Phi^{m+1}(r)

Приближённая энтропия (ApEn) показывает, насколько регулярен ряд интервалов между ударами сердца: это средний логарифм правдоподобия того, что отрезки ударов, близкие на протяжении mm ударов, остаются близкими и на m+1m+1. У неё нет единицы измерения.

Зачем нужен этот показатель

Steven Pincus предложил приближённую энтропию в 1991 году как способ выразить числом сложность системы по сравнительно короткой зашумлённой записи, примерно из тысячи точек. Тогда модный инструмент, корреляционная размерность, требовал куда больше данных и мог по ошибке «обнаружить» хаос. Для сердечного ритма приближённая энтропия даёт низкое значение ровному повторяющемуся ряду и высокое — непредсказуемому. Richman и Moorman показали в 2000 году, что у неё два недостатка: каждый отрезок считается совпадающим с самим собой, что гарантирует некоторое число совпадений и смещает результат в сторону регулярности, а смещение зависит от длительности записи, поэтому значения для записей разной длины несопоставимы. Их выборочная энтропия Выборочная энтропия Насколько непредсказуем ряд ударов сердца: минус логарифм вероятности того, что совпавшие отрезки из нескольких ударов совпадут и при увеличении на один удар. Около 0 — повторяющийся ряд, 2 и больше — почти случайный. Подробнее: Выборочная энтропия построена так, чтобы устранить оба недостатка, и предпочтительнее именно она.

Формула

ApEn(m,r)=Φm(r)−Φm+1(r),Φm(r)=1N−m+1∑iln⁡Cim(r)\mathrm{ApEn}(m, r) = \Phi^{m}(r) - \Phi^{m+1}(r),\qquad \Phi^{m}(r) = \frac{1}{N-m+1}\sum_{i}\ln C_i^{m}(r)

Для каждого отрезка из mm ударов найдите долю Cim(r)C_i^m(r) всех отрезков (включая его самого), которые лежат от него в пределах rr, возьмите логарифм и усредните логарифмы: получится Φm\Phi^m. Сделайте то же для отрезков на один удар длиннее и вычтите. Обычно mm равно 2, а rr — 0,2 стандартного отклонения интервалов.

Пример расчёта

Насколько предсказуем следующий удар?

Пять минут учебной записи

SampEn
1,67
ApEn
1,02
Допуск r
5,7 мс
совпадения по m
13
совпадения по m+1
1

Покой, m = 2, r = 0,20 × SD = 5,7 мс. Выделенный отрезок (m = 2) совпадает с другими отрезками в пределах 5,7 мс: всего совпадений — 13; из них сохраняются при удлинении обоих отрезков на один удар — 1. При подсчёте по всем отрезкам записи выборочная энтропия равна 1,67: дыхательный ритм делает следующий удар отчасти предсказуемым.

Элементы управления работают при включённом JavaScript.

Первые 64 ударов учебной записи. Один отрезок из m ударов выделен, вокруг каждого удара — полоса ±r; любой другой отрезок, остающийся внутри полосы, считается совпадением, а более тёмные рамки — совпадения, которые сохраняются и при удлинении на один удар. Выборочная энтропия (SampEn) — это минус логарифм доли совпадений, сохранившихся при удлинении, по всей записи; приближённая энтропия (ApEn) — её предшественница. Меняйте m и r или переключайтесь на периодический или случайный ряд.

Линейный график интервалов между ударами сердца по порядку (всего 64). Выделенная рамка отмечает образец из m ударов с полосой допуска плюс-минус r миллисекунд вокруг каждого удара; светлые рамки отмечают другие отрезки из m ударов, совпадающие с образцом в пределах полосы, а тёмные — те, которые совпадают и тогда, когда оба отрезка длиннее на один удар. Ниже выведены выборочная энтропия, приближённая энтропия, допуск в миллисекундах и число совпадений в двух вариантах, а затем объясняющее их предложение. Два ползунка задают m (от 1 до 4 ударов) и r (от 0,1 до 0,6 стандартного отклонения); три кнопки выбирают периодический ряд, запись в покое или случайные удары.

Пять минут учебной записи дают приближённую энтропию 1,02 при выборочной энтропии 1,67 с теми же m=2m = 2 и rr = 5,7 мс. Разница между двумя числами — это смещение из-за совпадения с самим собой: случайный пресет даёт 1,10 по ApEn против 2,35 по SampEn. На рисунке показаны один эталонный отрезок, полоса допуска вокруг него и отрезки, которые с ним совпали.

Что на неё влияет

То же, что и на выборочную энтропию: ровное дыхание её снижает, неровное дыхание, артефакты Артефакт Ошибка в записи сердечного ритма: пропущенный, лишний или неточно отмеченный удар, часто из-за движения или плохого контакта датчика. Артефакты могут сильно исказить показатели ВСР. Подробнее: Артефакт и шум повышают, а mm, rr и длительность записи тоже сдвигают её значение. Из-за смещения от самосовпадения на тех же данных она ниже выборочной энтропии и тем сильнее падает, чем короче запись.

Когда она вводит в заблуждение

Всегда, когда сравнивают записи разной длины, и когда её читают как чистое свойство сердца, а не записи, параметров и программы. Shaffer и Ginsberg описывают большие значения как низкую предсказуемость, а выборочную энтропию — как менее смещённый показатель.

Где вы её увидите

Kubios HRV выводит ApEn рядом с SampEn среди нелинейных показателей, оба по умолчанию с m=2m = 2 и r=0.2×SDNNr = 0.2 \times \mathrm{SDNN}. Её приводят старые научные работы; в новых используют выборочную энтропию. Носимые устройства её не показывают.

Источники

  1. Approximate entropy as a measure of system complexity Proceedings of the National Academy of Sciences, 1991
  2. Physiological time-series analysis using approximate entropy and sample entropy American Journal of Physiology: Heart and Circulatory Physiology, 2000
  3. An overview of heart rate variability metrics and norms Frontiers in Public Health, 2017
  4. HRV analysis methods Kubios

Все термины глоссария